Madrasah Nuurul Quran merupakan sekolah bermanhaj ahlus-sunnah wal jama’ah yang menggabungkan antara penguasaan ilmu umum dan ilmu syar`i secara optimal. Sistem pendidikan terpadu disusun berdasarkan sistem pendidikan nasional dalam koridor manhaj ahlus sunnah wal jama’ah.

Kurikulum pembelajaran menerapkan gabungan Kurikulum 2013 dan kurikulum Kementerian Agama RI untuk mata pelajaran Pendidikan Agama Islam. Selain itu terdapat muatan kurikulum lainnya, baik yang dikeluarkan oleh Pemerintah Propinsi dan Pemerintah Daerah atau yang dikembangkan oleh madrasah. Untuk tahun ajaran 2024/2025 mulai diterapkannya Kurikulum Merdeka bagi siswa kelas 7 di jenjang MTs dan kelas 10 di jenjang MA

Kegiatan belajar mengajar dimulai jam 06.30 WIB pagi dan berakhir pada jam 15.00 WIB.
Berlangsung 5 hari dalam sepekan.
Libur madrasah di hari Jumat dan Sabtu.
Kelas terpisah antara kelas siswa dan kelas siswi.

Madrasah menerapkan “full day school”, sehingga menyiapkan makan siang bagi para peserta didik kecuali di hari Senin dan Kamis.
Di hari Senin dan Kamis, peserta didik dianjurkan melaksanakan puasa sunnah sebagai bentuk pembelajaran dan pengamalan dari sunnah rasul shallallahu ‘alaihi wasallam.

Saat ini, madrasah melaksanakan 3 macam program

1. Madrasah Tsanawiyah

2. Madrasah Aliyah

3. Madrasah Sore